L'entrainement suit le principe du supervisé, on compare la sortie du réseau de neurones et la réponse attendue. Cette réponse n'est pas donné par des labels (informations supplémentaires en plus des données d'entrées), mais par une information déjà présente dans les données d'entrées. Dans les AE, on compare la sortie du réseau à l'entrée du réseau.